Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms