Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms