Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWDEQ8N2E2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms