Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC2Q8N158 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms