Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4Q8IY92 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms