Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLD3Q8IV08 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms