Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT27Q7Z3Y8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms