Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms