Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF550Q7Z398 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms