Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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