Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1Q6PKG0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms