Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms