Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3HQ6NTF7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms