Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCSD1Q6JBY9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms