Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms