Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH4AQ5TD94 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH4AQ5TD94 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms