Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD1Q5SYB0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms