Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMER1Q5JTC6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMER1Q5JTC6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms