Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms