Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms