Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL24A1Q17RW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms