Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME3Q16798 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME3Q16798 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME3Q16798 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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