Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPE65Q16518 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RPE65Q16518 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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