Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN2Q16513 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN2Q16513 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms