Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms