Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F4Q16254 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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