Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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