Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD1CQ15652 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms