Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms