Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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