Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms