Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms