Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCOF1Q13428 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCOF1Q13428 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
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