Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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