Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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