Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
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