Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms