Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms