Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms