Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB1P82279 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CRB1P82279 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB1P82279 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms