Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PROK1P58294 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PROK1P58294 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PROK1P58294 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PROK1P58294 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PROK1P58294 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PROK1P58294 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PROK1P58294 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PROK1P58294 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms