Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA9P57773 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA9P57773 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms