Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms