Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP1P56182 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP1P56182 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP1P56182 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms