Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms