Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA4P51532 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms