Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAMP50895 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAMP50895 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms