Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TTPAP49638 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TTPAP49638 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTPAP49638 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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