Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRXP46100 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRXP46100 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRXP46100 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms