Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms